以下是安裝 MySQL 後可以嘗試的優化項目，建議逐樣項目修改，以檢視每個項目的優化成效，而大部份的設定可以在運行中 MySQL 設定，不用重新啟動 MySQL。
innodb_buffer_pool_size: 這個設定是 innodb 儲存引擎資料庫，所使用的資料及索引快取，根據記憶體的大小䀆量設定大一點，可以減低讀取資料時從硬碟讀取的次數。如果是獨立的 MySQL 伺服器，可以這樣設定：
系統 8GB 記憶體： 5GB – 6GB
系統 32GB 記憶體： 20GB – 25GB
系統 128GB 記憶體： 100GB – 120GB
innodb_log_file_size: 這是 redo logs 的體積，redo logs 可以更快速地寫入，預設值是 2GB，這個設定可以從 2GB 開始逐步增加，以找到最適合的設定。MySQL 5.5 最大可以設定成 4GB, 而 MySQL 5.6 開始則沒有這個限制。
max_connections: 如果 MySQL 伺服器經常出現 “Too many connections” 錯誤，那便表示 “max_connections” 設定太低，預設值是 151, 可以從 500 開始設定，如果還遇到 “Too many connections” 問題，才逐步增加測試。
innodb_file_per_table: 這個不是效能上的優化，而是使 InnoDB 資料表管理更方便。當設定成 off 時，所有 InnoDB 資料表的資料及索引會儲存在一個 .ibd 檔案，如果設定成 on, 每個資料表會有一個獨立的 .ibd 檔。
MySQL 5.6 開始預設是 on, 之前的版本預設是 off.
innodb_flush_method: 設定資料及快取如果寫入硬碟，當系統有 RAID 卡及支援電池保護 write-back 快取，建議設定成 O_DIRECT.
innodb_log_buffer_size: 這是 transactions 的緩存大小，預設值是 1MB, 如果 transactions 的欄位是 blob 或 text，援存很快會用盡，可以逐步增加。
log_bin: 當設定成 replication master 時，log_bin 必須開啟，對於單獨的 MySQL 伺服器，也可以用作恢復資料。但由於會增加系統的硬碟 I/O 動作，如果沒有以上兩個需要，可以關閉。
skip_name_resolve: 當客戶端連接到 MySQL 伺服器， MySQL 會解析 hostname, 當 DNS 的解析緩慢時，建立連接也會一同變得緩慢，這樣可以關閉，但缺點是設定達端使用者登入時，只可以用 IP, 而不可以用 hostname.